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    盤長孢菌菌種的鑒定方法

    點擊次數(shù):964次  更新時間:2016-12-19

    盤長孢菌菌種的鑒定方法
    (1)常規(guī)鑒定 常規(guī)鑒定內(nèi)容有形態(tài)特征和生理生化特征。形態(tài)特征包括顯微形態(tài)和培養(yǎng)特征;理化特性包括營養(yǎng)類型、碳氮源利用能力、各種代謝反應(yīng)、酶反應(yīng)等。
    (2)分子生物學(xué)鑒定 應(yīng)用分子生物學(xué)方法從遺傳進化角度闡明微生物種群之間的分類學(xué)關(guān)系,是目前微生物分類學(xué)研究普遍采用的鑒定方法。CICC擁有微生物菌種分類鑒定的分子生物學(xué)實驗室,配有PCR儀、高速冷凍離心機、電泳儀、HPLC、凝膠成像系統(tǒng)、紫外控溫分析系統(tǒng)等先進儀器設(shè)備,以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等序列分析軟件。盤長孢菌目前CICC可采用核酸序列分析法分析細菌16S rDNA/16S-23S rDNA區(qū)間序列、酵母18S rDNA/26S rDNA(D1/D2)序列及絲狀真菌的18S rDNA/ ITS1-5.8S-ITS2序列,提供科學(xué)的鑒定結(jié)果。
    (3)功能性分析及功能基因 經(jīng)單位不斷致力于工業(yè)微生物資源的功能及其功能基因研究,目前通過木聚糖酶、纖維素酶、葡萄糖異構(gòu)酶、β-甘露聚糖酶等功能基因的克隆進行菌種產(chǎn)酶的功能性分析。應(yīng)用gyrA、atpD及pheS等看家基因于微生物菌種鑒定,在某些種、亞種、株間有較好的分辨效果。
    (4)API細菌數(shù)值鑒定系統(tǒng) API鑒定系統(tǒng)涵蓋15個鑒定系列,約有1000種生化反應(yīng),目前已可鑒定超過600種的細菌。鑒定過程中,可根據(jù)細菌所屬類群選擇適當?shù)纳砩b定系列,通過軟件將待測細菌與數(shù)據(jù)庫參比,得出鑒定結(jié)果。 CICC目前可應(yīng)用API 50CH系列、API 20 E系列、API Staph系列對乳酸桿菌(Lactobacillus sp.)和相關(guān)細菌、芽孢桿菌(Bacillus sp.)、葡萄球菌屬(Staphylococcus sp.)、微球菌屬(Micrococcus sp.)和庫克菌屬(Locuria sp.)進行鑒定。(5)RAPD、SSCP技術(shù) 隨著微生物菌種應(yīng)用的進一步發(fā)展,在食品安全管理、生物產(chǎn)品出口認證、知識產(chǎn)權(quán)保護等行業(yè)需求日益增加,盤長孢菌菌種株水平的鑒別技術(shù)成為一個迫切需要解決的問題。

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